「超能干探」描写两位至交好友，陈一贤(郭晋安饰)及方志强(刘锡明饰)，两人至同道合一起考进了警察学校，后又分发到同一单位服务
。　　强生性善良没有心机，但处事有原则
，不愿随波逐流，因此屡遭局内同僚排斥
。而好友贤则恰相反，他聪明机伶
，做人有手腕、心机深，起嫉妒心重，为了名利不择手段，因此很受同事长官器重。　　一次，强在缉捕行动中受伤，子弹贯穿心肺之间，奇迹式的存活下来，但却从此产生了「超能力」。强连自己也不太能理解为什么能够「以眼代手」
、「移形换影」或「电磁效应」。幸有一位奇人沈节(谷峰饰)，教强控制自己的超能力。　　强与贤在一次缉捕歹徒的行动中，惊险万分
，贤不慎受枪伤，而强则在危机中，不知不觉的使用了超能力逮捕获歹徒
，强因而升职。　　阮雯原为贤之女友，她一心一意守在贤身旁

，但贤却因自私多次冷落阮雯，令阮雯若有所失。强自小暗恋雯，乃不时给予鼓励；雯不受贤重视，找强倾吐，两人爱苗渐滋生
。　　贤嫉妒强的升职，雯又向贤提出分手
，并坦言爱上贤
，贤因此更加愤恨。强被长官指派为诱饵，险象环生中又以超能力捕获歹徒，此时
，高人石龙(王龙威饰)出现

，以高强的功力将歹徒灭口。　　贤亲眼目睹石龙的超能力，乃告知强
，强一时大意，将子己拥有超能力之事坦言告之；贤乃求见沈节
，沈节一眼看穿贤心术不正
，劝他勿接近石龙，以免误入魔道。　　但贤因公事不顺遂
，巧遇石龙
，石龙引诱他做徒弟
，贤名利薰心
，开始向石龙学习超能力。　　马凤儿(彭家丽饰)因偶然的机会
，认识了强的母亲关静红(苏杏璇饰)，两人颇为投缘
，红不但将凤儿带回家，并要强照料凤儿。凤儿刁钻活泼，初时常捉弄强，但逐渐了解强的忠厚后，渐爱上强。贤因得知凤儿显赫的身世，利用强结识凤儿，贤渐对凤儿产生情愫
，但凤儿却对贤没感觉，唯对强情有独钟。而雯虽屡遭凤儿言语及行动骚扰，却始终默默忍受。　　贤与强被分为不同的二组
，共同打击犯罪。但两组组长处事不合

，导致两组人马处处抢功；在共同追查一桩重大刑案时
，石龙因参与其中，龙要胁贤干出杀人勾当

，自此
，贤身陷魔道而不能自拔。　　强之师父沈节原是大陆公安
，来港为逮捕超能力高人石龙回大陆受审

。强在不屈不挠的追查下
，真相逐渐被解开，正当他掌握罪证据

，却被石龙拦截
，龙正要向强下毒手时，幸好沈节赶到
，虽打走了龙但却身受重伤。凤儿也为了救强而牺牲了生命。　　贤怕自己的事迹败露，不断以超能力杀人，并设计陷害强，强虽知贤种钟恶行，但顾念往惜情谊
，不愿与贤决裂。　　龙见贤事迹败露
，认为贤已无利用价值
，欲杀贤
，幸得强与节搭救。贤不知悔改，反而悟得更深之魔法，将石龙除去，并做恶不断。　　强忍无可忍，故意将雯遣至美国
，并将红送回乡下
，在无后顾之忧后，痛下决定和贤展开一场生死大对决.....。